Kolmapäev, 18. september 2013. - USA-s San Diegos asuva California ülikooli teadlased pakuvad välja uue lähenemisviisi, mida nimetatakse võrgupõhiseks kihistumiseks (NBS), et tuvastada vähi alatüübid selle järgi, kuidas mutatsioonid mõjutavad võrgud või geneetilised süsteemid, mida jagatakse iga patsiendi ainulaadsete mutatsioonide asemel, nagu on avaldatud selle pühapäeva täiustatud digiväljaandes „Loodusmeetodid”.
Vähktõve kasvajatel pole peaaegu kunagi samu täpseid geneetilisi mutatsioone, mis on segi ajanud teaduse pingutused vähitüüpide paremaks klassifitseerimiseks ning spetsiifilisemate ja tõhusamate ravimite väljatöötamiseks.
"Alatüüpimine on kõige põhilisem samm personaliseeritud meditsiini eesmärgi poole, " ütles San Diegos asuva California ülikooli meditsiinikooli geneetikaosakonna juhataja ja professorite osakonna professor Trey Ideker. Meditsiin ja sama ülikooli keskuse bioinsener.
"Patsientide andmete põhjal jaotatakse patsiendid alamtüüpidesse koos nendega seotud raviga. Näiteks teatakse, et vähi alatüüp reageerib hästi ravimile A, kuid mitte ravimile B. Ilma alatüüpideta on igal patsiendil sama aspekt oma määratluse järgi ja me ei tea, kuidas teisiti käituda, "selgitas ta.
Viimased teadmiste ja tehnoloogia edusammud on hõlbustanud (ja odavamat) üksikute genoomide järjestamist, eriti vähktõve ravis, mis on põhimõtteliselt geenide haigus.
Kuid geenid on "tohutult heterogeensed", ütles Ideker. Muudest teguritest mõjutatud muteerunud geenid põhjustavad selliseid haigusi nagu vähk, patoloogia, mis on iga patsiendi jaoks geneetiliselt ainulaadne - fakt, mis võib mõjutada kliinilise ravi efektiivsust ja tulemusi.
"Kui vaatame patsientide andmeid geenitasemel, näevad kõik välja erinevad, " sõnas Ideker. "Kuid kui vaadata mõjutatud võrgustikke ja bioloogilisi süsteeme, siis need näivad olevat klastrid. Samas kohas pole muteerunud geene, vaid mutatsioonid esinevad samades geneetilistes radades, " ütles see ekspert.
Nimelt täheldasid teadlased kopsu-, emaka- ja munasarjavähki põdevate patsientide andmetes kopsu-, emaka- ja munasarjavähiga patsientide somaatilisi mutatsioone kasvajate, kuid mitte tervete kudede puhul, mis on jätkuv programm Rahvusvahelise Instituudi Ameerika tervis, et koguda ja kataloogida tuhandete vähihaigete genoome.
Ideker ütles, et NBS-i lähenemisel on otsene kliiniline kasu. Vähihaigete genoomi järjestamine on kiiresti muutumas diagnoosi standardseks osaks, nii et selle teadlase sõnul saavad arstid kasutada NBS-i, et paremini kohandada vähktõve alatüübiga ravi ja sõltuvalt ravi tulemustest Tooge leiud tagasi andmebaasi, et täpsustada ja parendada vähiteraapiaid, et need oleksid indiviidide jaoks võimalikult isikupärastatud.
Allikas:
Silte:
Lõigatud Ja Laste Ravimid Väljaregistreerimisel
Vähktõve kasvajatel pole peaaegu kunagi samu täpseid geneetilisi mutatsioone, mis on segi ajanud teaduse pingutused vähitüüpide paremaks klassifitseerimiseks ning spetsiifilisemate ja tõhusamate ravimite väljatöötamiseks.
"Alatüüpimine on kõige põhilisem samm personaliseeritud meditsiini eesmärgi poole, " ütles San Diegos asuva California ülikooli meditsiinikooli geneetikaosakonna juhataja ja professorite osakonna professor Trey Ideker. Meditsiin ja sama ülikooli keskuse bioinsener.
"Patsientide andmete põhjal jaotatakse patsiendid alamtüüpidesse koos nendega seotud raviga. Näiteks teatakse, et vähi alatüüp reageerib hästi ravimile A, kuid mitte ravimile B. Ilma alatüüpideta on igal patsiendil sama aspekt oma määratluse järgi ja me ei tea, kuidas teisiti käituda, "selgitas ta.
Viimased teadmiste ja tehnoloogia edusammud on hõlbustanud (ja odavamat) üksikute genoomide järjestamist, eriti vähktõve ravis, mis on põhimõtteliselt geenide haigus.
Kuid geenid on "tohutult heterogeensed", ütles Ideker. Muudest teguritest mõjutatud muteerunud geenid põhjustavad selliseid haigusi nagu vähk, patoloogia, mis on iga patsiendi jaoks geneetiliselt ainulaadne - fakt, mis võib mõjutada kliinilise ravi efektiivsust ja tulemusi.
"Kui vaatame patsientide andmeid geenitasemel, näevad kõik välja erinevad, " sõnas Ideker. "Kuid kui vaadata mõjutatud võrgustikke ja bioloogilisi süsteeme, siis need näivad olevat klastrid. Samas kohas pole muteerunud geene, vaid mutatsioonid esinevad samades geneetilistes radades, " ütles see ekspert.
Nimelt täheldasid teadlased kopsu-, emaka- ja munasarjavähki põdevate patsientide andmetes kopsu-, emaka- ja munasarjavähiga patsientide somaatilisi mutatsioone kasvajate, kuid mitte tervete kudede puhul, mis on jätkuv programm Rahvusvahelise Instituudi Ameerika tervis, et koguda ja kataloogida tuhandete vähihaigete genoome.
Ideker ütles, et NBS-i lähenemisel on otsene kliiniline kasu. Vähihaigete genoomi järjestamine on kiiresti muutumas diagnoosi standardseks osaks, nii et selle teadlase sõnul saavad arstid kasutada NBS-i, et paremini kohandada vähktõve alatüübiga ravi ja sõltuvalt ravi tulemustest Tooge leiud tagasi andmebaasi, et täpsustada ja parendada vähiteraapiaid, et need oleksid indiviidide jaoks võimalikult isikupärastatud.
Allikas: